طرق التقاط التشكل الكروموسوم (3C)تكشف عن تنظيم الكروموسوم داخل النواة عن طريق تحديد القرب المادي لأزواج من النقاط على طول الكروماتين. يحافظون على تفاعلات الكروماتين من خلال الربط المتبادل متبوعًا بالتجزئة والربط والتسلسل للمناطق المتفاعلة.
كيف يعمل التقاط التشكل الكروموسوم؟
التقاط تشابه الكروموسوم على الرقاقة (4C)يلتقط التفاعلات بين موضع واحد وجميع المواقع الجينية الأخرى. وهي تنطوي على خطوة ربط ثانية ، لإنشاء شظايا DNA دائرية ذاتية ، والتي تُستخدم لإجراء PCR معكوس. … على مصفوفة ميكروأري واحدة ، يمكن تحليل ما يقرب من مليون تفاعل.
ما هو التقاط التشكل الكروماتين؟
التقاط تشابه الكروماتين (3C) هوتقنية مهمة تستخدم لدراسة بنية الكروماتين، بالإضافة إلى الأساس للعديد من التقنيات المشتقة الأخرى. … يشتمل البروتوكول على ربط الخلايا بالفورمالديهايد متبوعًا بعزل الكروماتين والهضم باستخدام إنزيم التقييد.
كيف يعمل تسلسل Hi-C؟
يمتد نهج Hi-C إلى3C-Seq لرسم خريطة لجهات اتصال الكروماتين على مستوى الجينوم، وقد تم تطبيقه أيضًا على دراسة تفاعلات الكروماتين في الموقع. في هذه الطريقة ، يتم ربط مجمعات بروتين DNA مع الفورمالديهايد. يتم تجزئة العينة ، ويتم استخلاص الحمض النووي وربطه وهضمه باستخدام إنزيمات تقييدية.
ما هي تقنية Hi-C؟
تقنية Hi-C الكلاسيكية تتضمنهضم مقيد لجينوم الفورمالديهايد المترابط مع إنزيمات تقييد محددة التسلسل، متبوعًا بملء وإصلاح النهايات المهضومة مع دمج النيوكليوتيدات المرتبطة بالبيوتين. ثم يتم إعادة ربط الأطراف التي تم إصلاحها.
